調試期缺點通常出現在表面設備調試時期，多見的調試期缺點通常由設備不當、環境煩擾以及流體特性影響等原因致使。
1)設備方面
通常是電磁流量傳感器設備方位不精確致使的缺點，多見的如將傳感器設備在易積累氣體的管系最高點;或設備在自上而下的垂直管上，或許出現排空;或傳感器后無背壓，流體直接排入大氣而構成測量管內非滿管。
2)環境方面
通常主要是管道雜散電流煩擾，空間強電磁波煩擾，大型電機磁場煩擾等。管道雜散電流煩擾通常采用出色的獨自接地保護就可獲得滿意效果，但如遇到強大的雜散電流(如電解車間管道，有時在兩電極上感應的交流電勢峰值Vpp可高達1V)，需要采用另外方法和流量傳感器與管道絕緣等。空間電磁波煩擾通常經信號電纜引入，通常選用單層或多層屏蔽予以保護。
3)流體方面
被測液體中含有均勻分布的細小氣泡通常不影響電磁流量計的正常工作，但跟著氣泡的增大，表面輸出信號會出現不堅定，若氣泡大到足以隱瞞悉數電極表面時，跟著氣泡流過電極會使電極回路霎時間斷路而使輸出信號出現更大的不堅定。
低頻方波勵磁的
電磁流量計測量固體含量過多漿液時，也將發作漿液噪聲，使輸出信號發作不堅定。
測量混合介質時，如果在混合未均勻前就進入流量傳感進行測量，也將使輸出信號發作不堅定。
電極材料與被測介質選配不當，也將由于化學作用或極化表象而影響正常測量。應根據表面選用或有關手冊精確選配電極材料。
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